Herramienta de Software para el Análisis de Datos Electroforéticos
Abstract
La electroforesis capilar (EC) es una técnica de separación que, basada en la química analítica, proporciona un mapa detallado (señal en el tiempo) de las sustancias que conforman una muestra bioquímica, representando las sustancias por picos donde la amplitud de los picos está
relacionada con la concentración de las sustancias en la muestra. Su valor radica en la capacidad de separar macromoléculas de interés en las áreas de biomédica, biofarmacéutica, alimentos, así como en el área de control ambiental. Debido a la poca reproducibilidad inherente en las señales electroforéticas, el análisis de los electroferogramas está basado en procedimientos visuales y manuales, tanto para el reconocimiento de patrones como para la medición de la concentración de las sustancias. En consecuencia, un método automatizado para la visualización y análisis de
electroferogramas resulta ser altamente deseable. En este trabajo se presenta una herramienta para el procesamiento y análisis de señales provenientes de electroforesis capilar (EC). En dicha herramienta los datos electroforéticos son previamente acondicionados en el dominio wavelet. Dicho
acondicionamiento involucra corrección de línea base, detección de zona de actividad, eliminación de saltos abruptos y reducción de componentes ruidosos. Se empleó para su desarrollo herramientas de software libre y de código abierto como wxWidgets (herramienta de visualización), ofreciendo una interfaz amigable, de fácil manejo, intuitiva, que permite satisfacer los requerimientos informáticos a
los médicos e investigadores en la interpretación de los electroferogramas. Para ello cuenta con una serie de opciones tanto de procesamiento como de visualización, integradas en pestañas verticales, barras horizontales (menú de opciones y herramientas de acceso rápido) y áreas de graficación donde se muestran los registros originales y los procesados. Adicionalmente, la herramienta cuenta con un
manual de usuario elaborado empleando técnicas de multimedia donde se muestra el funcionamiento de la aplicación. La programación modular de la herramienta facilita el mantenimiento del software implementado así como el desarrollo a futuro por parte de terceros quienes podrán incluir nuevos módulos de procesamiento y/o visualización ó modificar los existentes sin mayores complicaciones.
Esta herramienta corre en Windows 95/98/2000/NT/XP en un computador con un mínimo de recursos, ofreciendo la ventaja adicional de poder ser instalado en distintos sistemas operativos como Windows® y UNIX/Linux.
relacionada con la concentración de las sustancias en la muestra. Su valor radica en la capacidad de separar macromoléculas de interés en las áreas de biomédica, biofarmacéutica, alimentos, así como en el área de control ambiental. Debido a la poca reproducibilidad inherente en las señales electroforéticas, el análisis de los electroferogramas está basado en procedimientos visuales y manuales, tanto para el reconocimiento de patrones como para la medición de la concentración de las sustancias. En consecuencia, un método automatizado para la visualización y análisis de
electroferogramas resulta ser altamente deseable. En este trabajo se presenta una herramienta para el procesamiento y análisis de señales provenientes de electroforesis capilar (EC). En dicha herramienta los datos electroforéticos son previamente acondicionados en el dominio wavelet. Dicho
acondicionamiento involucra corrección de línea base, detección de zona de actividad, eliminación de saltos abruptos y reducción de componentes ruidosos. Se empleó para su desarrollo herramientas de software libre y de código abierto como wxWidgets (herramienta de visualización), ofreciendo una interfaz amigable, de fácil manejo, intuitiva, que permite satisfacer los requerimientos informáticos a
los médicos e investigadores en la interpretación de los electroferogramas. Para ello cuenta con una serie de opciones tanto de procesamiento como de visualización, integradas en pestañas verticales, barras horizontales (menú de opciones y herramientas de acceso rápido) y áreas de graficación donde se muestran los registros originales y los procesados. Adicionalmente, la herramienta cuenta con un
manual de usuario elaborado empleando técnicas de multimedia donde se muestra el funcionamiento de la aplicación. La programación modular de la herramienta facilita el mantenimiento del software implementado así como el desarrollo a futuro por parte de terceros quienes podrán incluir nuevos módulos de procesamiento y/o visualización ó modificar los existentes sin mayores complicaciones.
Esta herramienta corre en Windows 95/98/2000/NT/XP en un computador con un mínimo de recursos, ofreciendo la ventaja adicional de poder ser instalado en distintos sistemas operativos como Windows® y UNIX/Linux.
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ISSN 2591-3522